Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8BP10966 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8BP10966 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8BP10966 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8BP10966 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8BP10966 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8BP10966 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8BP10966 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8BP10966 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8BP10966 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8BP10966 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD8BP10966 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD8BP10966 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD8BP10966 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD8BP10966 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8BP10966 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8BP10966 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8BP10966 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8BP10966 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8BP10966 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8BP10966 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8BP10966 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8BP10966 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8BP10966 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8BP10966 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8BP10966 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8BP10966 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8BP10966 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8BP10966 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8BP10966 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8BP10966 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8BP10966 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8BP10966 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8BP10966 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8BP10966 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8BP10966 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8BP10966 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8BP10966 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8BP10966 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8BP10966 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8BP10966 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8BP10966 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8BP10966 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8BP10966 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8BP10966 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8BP10966 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8BP10966 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8BP10966 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8BP10966 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8BP10966 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8BP10966 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8BP10966 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8BP10966 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8BP10966 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms