Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
RGPD1P0DJD0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGPD1P0DJD0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms