Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC166P0CW27 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms