Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA6AP0CW24 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA6AP0CW24 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms