Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms