Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
POLA1P09884 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
POLA1P09884 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLA1P09884 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLA1P09884 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLA1P09884 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLA1P09884 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLA1P09884 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLA1P09884 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLA1P09884 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLA1P09884 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLA1P09884 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLA1P09884 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
POLA1P09884 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
POLA1P09884 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
POLA1P09884 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
POLA1P09884 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
POLA1P09884 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
POLA1P09884 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
POLA1P09884 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
POLA1P09884 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
POLA1P09884 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
POLA1P09884 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
POLA1P09884 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
POLA1P09884 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
POLA1P09884 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
POLA1P09884 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC37.39■■■■□ 3.58
POLA1P09884 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
POLA1P09884 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
POLA1P09884 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
POLA1P09884 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
POLA1P09884 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
POLA1P09884 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
POLA1P09884 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
POLA1P09884 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
POLA1P09884 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
POLA1P09884 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
POLA1P09884 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC37.38■■■■□ 3.57
POLA1P09884 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
POLA1P09884 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
POLA1P09884 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
POLA1P09884 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
POLA1P09884 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
POLA1P09884 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
POLA1P09884 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
POLA1P09884 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
POLA1P09884 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
POLA1P09884 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
POLA1P09884 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
POLA1P09884 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
POLA1P09884 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
POLA1P09884 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
POLA1P09884 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
POLA1P09884 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
POLA1P09884 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
POLA1P09884 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
POLA1P09884 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLA1P09884 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLA1P09884 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLA1P09884 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLA1P09884 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLA1P09884 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLA1P09884 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLA1P09884 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLA1P09884 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLA1P09884 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLA1P09884 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLA1P09884 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLA1P09884 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLA1P09884 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLA1P09884 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLA1P09884 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLA1P09884 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLA1P09884 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLA1P09884 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLA1P09884 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLA1P09884 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLA1P09884 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLA1P09884 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLA1P09884 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
POLA1P09884 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
POLA1P09884 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
POLA1P09884 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
POLA1P09884 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
POLA1P09884 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
POLA1P09884 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
POLA1P09884 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
POLA1P09884 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
POLA1P09884 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
POLA1P09884 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
POLA1P09884 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
POLA1P09884 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
POLA1P09884 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
POLA1P09884 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
POLA1P09884 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
POLA1P09884 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
POLA1P09884 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
POLA1P09884 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
POLA1P09884 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
POLA1P09884 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms