Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD48P09326 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD48P09326 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD48P09326 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD48P09326 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD48P09326 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD48P09326 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD48P09326 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD48P09326 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD48P09326 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD48P09326 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD48P09326 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD48P09326 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD48P09326 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD48P09326 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CD48P09326 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD48P09326 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CD48P09326 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD48P09326 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD48P09326 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD48P09326 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD48P09326 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD48P09326 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD48P09326 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD48P09326 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD48P09326 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD48P09326 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD48P09326 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD48P09326 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD48P09326 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD48P09326 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD48P09326 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD48P09326 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD48P09326 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CD48P09326 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD48P09326 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD48P09326 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD48P09326 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD48P09326 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD48P09326 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CD48P09326 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD48P09326 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD48P09326 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD48P09326 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD48P09326 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD48P09326 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD48P09326 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD48P09326 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD48P09326 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD48P09326 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD48P09326 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD48P09326 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD48P09326 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD48P09326 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD48P09326 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms