Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOP08100 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOP08100 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOP08100 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOP08100 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOP08100 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOP08100 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOP08100 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOP08100 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOP08100 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOP08100 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOP08100 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOP08100 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOP08100 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOP08100 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOP08100 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOP08100 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOP08100 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOP08100 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOP08100 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOP08100 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOP08100 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOP08100 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOP08100 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOP08100 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOP08100 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOP08100 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOP08100 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOP08100 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOP08100 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOP08100 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOP08100 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOP08100 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOP08100 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOP08100 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOP08100 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOP08100 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOP08100 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOP08100 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOP08100 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOP08100 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOP08100 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOP08100 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOP08100 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOP08100 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOP08100 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOP08100 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOP08100 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOP08100 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOP08100 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOP08100 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOP08100 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOP08100 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOP08100 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOP08100 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOP08100 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOP08100 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOP08100 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOP08100 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOP08100 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOP08100 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOP08100 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOP08100 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOP08100 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOP08100 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOP08100 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOP08100 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOP08100 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOP08100 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOP08100 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOP08100 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOP08100 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOP08100 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOP08100 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOP08100 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOP08100 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOP08100 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOP08100 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOP08100 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOP08100 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOP08100 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOP08100 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOP08100 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOP08100 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOP08100 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOP08100 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOP08100 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
RHOP08100 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOP08100 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOP08100 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOP08100 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOP08100 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOP08100 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOP08100 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOP08100 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOP08100 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOP08100 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOP08100 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOP08100 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOP08100 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms