Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB1P05937 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB1P05937 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB1P05937 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB1P05937 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB1P05937 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB1P05937 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB1P05937 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB1P05937 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB1P05937 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB1P05937 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB1P05937 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB1P05937 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB1P05937 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB1P05937 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALB1P05937 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CALB1P05937 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB1P05937 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB1P05937 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB1P05937 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB1P05937 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB1P05937 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB1P05937 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB1P05937 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB1P05937 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALB1P05937 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB1P05937 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB1P05937 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB1P05937 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB1P05937 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB1P05937 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB1P05937 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB1P05937 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB1P05937 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB1P05937 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB1P05937 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB1P05937 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB1P05937 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB1P05937 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB1P05937 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALB1P05937 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB1P05937 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB1P05937 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB1P05937 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB1P05937 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB1P05937 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB1P05937 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB1P05937 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB1P05937 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB1P05937 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB1P05937 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB1P05937 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALB1P05937 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB1P05937 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB1P05937 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB1P05937 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB1P05937 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB1P05937 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB1P05937 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB1P05937 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB1P05937 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB1P05937 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB1P05937 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB1P05937 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB1P05937 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALB1P05937 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB1P05937 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB1P05937 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB1P05937 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB1P05937 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB1P05937 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALB1P05937 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms