Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCGP05129 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms