Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP1A1P05023 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1A1P05023 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A1P05023 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A1P05023 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A1P05023 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A1P05023 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A1P05023 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A1P05023 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms