Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A1P02730 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms