Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPTA1P02549 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms