Protein–RNA interactions for Protein: P01588

EPO, Erythropoietin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOP01588 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPOP01588 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPOP01588 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPOP01588 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPOP01588 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPOP01588 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPOP01588 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPOP01588 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPOP01588 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPOP01588 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPOP01588 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOP01588 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOP01588 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOP01588 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOP01588 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOP01588 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOP01588 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOP01588 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOP01588 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOP01588 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOP01588 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOP01588 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOP01588 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOP01588 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOP01588 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOP01588 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOP01588 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOP01588 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOP01588 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOP01588 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOP01588 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOP01588 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOP01588 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOP01588 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOP01588 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOP01588 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOP01588 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOP01588 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOP01588 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOP01588 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOP01588 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOP01588 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOP01588 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOP01588 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOP01588 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOP01588 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOP01588 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOP01588 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOP01588 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOP01588 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOP01588 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOP01588 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOP01588 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOP01588 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOP01588 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOP01588 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPOP01588 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPOP01588 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPOP01588 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOP01588 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOP01588 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOP01588 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOP01588 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOP01588 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOP01588 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOP01588 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOP01588 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOP01588 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOP01588 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOP01588 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPOP01588 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPOP01588 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPOP01588 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPOP01588 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPOP01588 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPOP01588 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EPOP01588 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPOP01588 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPOP01588 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EPOP01588 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EPOP01588 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPOP01588 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPOP01588 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPOP01588 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPOP01588 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms