Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA21P01568 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA21P01568 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms