Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED1O96006 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED1O96006 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
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