Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TOP3BO95985 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP3BO95985 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms