Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX18O95935 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX18O95935 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX18O95935 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX18O95935 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX18O95935 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX18O95935 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX18O95935 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX18O95935 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX18O95935 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX18O95935 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX18O95935 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX18O95935 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX18O95935 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX18O95935 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX18O95935 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX18O95935 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX18O95935 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX18O95935 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBX18O95935 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBX18O95935 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX18O95935 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX18O95935 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX18O95935 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX18O95935 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX18O95935 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX18O95935 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX18O95935 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX18O95935 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX18O95935 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX18O95935 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX18O95935 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBX18O95935 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX18O95935 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX18O95935 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX18O95935 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX18O95935 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBX18O95935 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX18O95935 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX18O95935 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX18O95935 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX18O95935 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX18O95935 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX18O95935 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX18O95935 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX18O95935 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX18O95935 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX18O95935 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX18O95935 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBX18O95935 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX18O95935 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX18O95935 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX18O95935 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX18O95935 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX18O95935 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX18O95935 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX18O95935 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX18O95935 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX18O95935 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX18O95935 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX18O95935 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX18O95935 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX18O95935 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBX18O95935 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBX18O95935 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms