Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TSPAN13O95857 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TSPAN13O95857 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TSPAN13O95857 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TSPAN13O95857 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TSPAN13O95857 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TSPAN13O95857 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TSPAN13O95857 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TSPAN13O95857 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TSPAN13O95857 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms