Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL3O95573 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms