Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBF1O95248 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBF1O95248 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBF1O95248 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBF1O95248 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBF1O95248 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBF1O95248 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBF1O95248 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SBF1O95248 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SBF1O95248 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SBF1O95248 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SBF1O95248 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SBF1O95248 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SBF1O95248 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SBF1O95248 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SBF1O95248 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SBF1O95248 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SBF1O95248 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SBF1O95248 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SBF1O95248 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SBF1O95248 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SBF1O95248 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SBF1O95248 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SBF1O95248 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SBF1O95248 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SBF1O95248 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SBF1O95248 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SBF1O95248 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SBF1O95248 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SBF1O95248 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBF1O95248 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBF1O95248 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBF1O95248 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBF1O95248 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBF1O95248 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBF1O95248 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBF1O95248 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBF1O95248 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBF1O95248 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBF1O95248 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBF1O95248 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBF1O95248 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBF1O95248 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBF1O95248 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SBF1O95248 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SBF1O95248 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SBF1O95248 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SBF1O95248 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SBF1O95248 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SBF1O95248 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBF1O95248 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBF1O95248 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBF1O95248 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBF1O95248 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBF1O95248 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBF1O95248 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBF1O95248 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBF1O95248 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBF1O95248 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SBF1O95248 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBF1O95248 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBF1O95248 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBF1O95248 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBF1O95248 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SBF1O95248 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SBF1O95248 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SBF1O95248 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SBF1O95248 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SBF1O95248 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SBF1O95248 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SBF1O95248 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SBF1O95248 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SBF1O95248 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SBF1O95248 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SBF1O95248 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SBF1O95248 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SBF1O95248 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SBF1O95248 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SBF1O95248 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SBF1O95248 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SBF1O95248 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBF1O95248 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SBF1O95248 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBF1O95248 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBF1O95248 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBF1O95248 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBF1O95248 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SBF1O95248 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBF1O95248 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBF1O95248 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBF1O95248 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBF1O95248 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBF1O95248 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBF1O95248 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBF1O95248 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBF1O95248 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SBF1O95248 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SBF1O95248 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SBF1O95248 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SBF1O95248 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms