Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE4BO95155 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE4BO95155 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE4BO95155 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms