Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCC1O94876 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCC1O94876 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms