Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24DO94855 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24DO94855 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24DO94855 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24DO94855 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24DO94855 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24DO94855 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24DO94855 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24DO94855 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24DO94855 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEC24DO94855 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24DO94855 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24DO94855 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24DO94855 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEC24DO94855 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24DO94855 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24DO94855 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24DO94855 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24DO94855 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24DO94855 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24DO94855 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24DO94855 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24DO94855 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24DO94855 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24DO94855 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24DO94855 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24DO94855 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24DO94855 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24DO94855 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24DO94855 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24DO94855 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24DO94855 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24DO94855 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24DO94855 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24DO94855 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24DO94855 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24DO94855 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24DO94855 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24DO94855 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24DO94855 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24DO94855 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24DO94855 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24DO94855 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24DO94855 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24DO94855 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24DO94855 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24DO94855 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24DO94855 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24DO94855 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24DO94855 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24DO94855 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24DO94855 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24DO94855 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24DO94855 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24DO94855 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEC24DO94855 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24DO94855 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24DO94855 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24DO94855 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24DO94855 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24DO94855 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEC24DO94855 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24DO94855 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24DO94855 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24DO94855 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEC24DO94855 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24DO94855 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24DO94855 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24DO94855 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24DO94855 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24DO94855 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24DO94855 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24DO94855 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24DO94855 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24DO94855 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24DO94855 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24DO94855 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24DO94855 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEC24DO94855 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms