Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP1O94782 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP1O94782 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP1O94782 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP1O94782 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP1O94782 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP1O94782 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP1O94782 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP1O94782 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP1O94782 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP1O94782 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP1O94782 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP1O94782 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP1O94782 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP1O94782 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP1O94782 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP1O94782 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP1O94782 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP1O94782 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP1O94782 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP1O94782 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP1O94782 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP1O94782 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP1O94782 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP1O94782 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP1O94782 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP1O94782 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP1O94782 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP1O94782 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP1O94782 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP1O94782 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP1O94782 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP1O94782 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP1O94782 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP1O94782 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP1O94782 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP1O94782 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP1O94782 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP1O94782 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP1O94782 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP1O94782 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP1O94782 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP1O94782 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP1O94782 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP1O94782 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP1O94782 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP1O94782 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP1O94782 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP1O94782 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP1O94782 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP1O94782 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP1O94782 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP1O94782 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP1O94782 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP1O94782 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP1O94782 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP1O94782 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP1O94782 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP1O94782 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP1O94782 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP1O94782 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP1O94782 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
USP1O94782 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP1O94782 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP1O94782 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP1O94782 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP1O94782 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP1O94782 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms