Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN5O94779 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN5O94779 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN5O94779 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTN5O94779 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTN5O94779 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN5O94779 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN5O94779 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms