Protein–RNA interactions for Protein: O76013

KRT36, Keratin, type I cuticular Ha6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT36O76013 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT36O76013 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT36O76013 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT36O76013 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT36O76013 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT36O76013 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT36O76013 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT36O76013 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT36O76013 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT36O76013 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT36O76013 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT36O76013 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT36O76013 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT36O76013 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT36O76013 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT36O76013 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT36O76013 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT36O76013 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT36O76013 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT36O76013 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT36O76013 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT36O76013 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT36O76013 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT36O76013 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT36O76013 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT36O76013 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT36O76013 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT36O76013 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT36O76013 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT36O76013 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT36O76013 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT36O76013 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT36O76013 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT36O76013 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT36O76013 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT36O76013 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT36O76013 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT36O76013 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT36O76013 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT36O76013 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT36O76013 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT36O76013 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT36O76013 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT36O76013 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT36O76013 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT36O76013 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT36O76013 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT36O76013 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT36O76013 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT36O76013 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT36O76013 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT36O76013 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT36O76013 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT36O76013 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT36O76013 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT36O76013 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT36O76013 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT36O76013 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT36O76013 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT36O76013 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT36O76013 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT36O76013 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT36O76013 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT36O76013 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT36O76013 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT36O76013 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT36O76013 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT36O76013 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT36O76013 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT36O76013 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT36O76013 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT36O76013 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT36O76013 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT36O76013 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT36O76013 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT36O76013 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT36O76013 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT36O76013 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT36O76013 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT36O76013 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT36O76013 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT36O76013 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT36O76013 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT36O76013 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT36O76013 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT36O76013 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT36O76013 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT36O76013 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT36O76013 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms