Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB3O75712 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB3O75712 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB3O75712 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB3O75712 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB3O75712 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB3O75712 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB3O75712 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB3O75712 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB3O75712 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB3O75712 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB3O75712 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB3O75712 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB3O75712 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB3O75712 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB3O75712 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB3O75712 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB3O75712 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB3O75712 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB3O75712 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB3O75712 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB3O75712 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB3O75712 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB3O75712 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB3O75712 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB3O75712 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB3O75712 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB3O75712 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB3O75712 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB3O75712 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB3O75712 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB3O75712 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB3O75712 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB3O75712 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB3O75712 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB3O75712 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB3O75712 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB3O75712 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB3O75712 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB3O75712 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB3O75712 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB3O75712 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB3O75712 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB3O75712 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB3O75712 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB3O75712 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB3O75712 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB3O75712 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB3O75712 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB3O75712 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB3O75712 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB3O75712 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB3O75712 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB3O75712 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB3O75712 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB3O75712 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB3O75712 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB3O75712 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB3O75712 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB3O75712 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB3O75712 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB3O75712 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB3O75712 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB3O75712 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB3O75712 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB3O75712 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB3O75712 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB3O75712 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB3O75712 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB3O75712 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB3O75712 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB3O75712 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB3O75712 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB3O75712 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB3O75712 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB3O75712 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB3O75712 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB3O75712 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB3O75712 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB3O75712 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB3O75712 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJB3O75712 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJB3O75712 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJB3O75712 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB3O75712 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms