Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms