Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms