Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK1O75385 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK1O75385 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ULK1O75385 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK1O75385 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK1O75385 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK1O75385 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ULK1O75385 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK1O75385 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK1O75385 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK1O75385 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK1O75385 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK1O75385 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ULK1O75385 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK1O75385 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK1O75385 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ULK1O75385 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK1O75385 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ULK1O75385 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK1O75385 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ULK1O75385 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK1O75385 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK1O75385 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ULK1O75385 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK1O75385 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK1O75385 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK1O75385 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK1O75385 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK1O75385 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK1O75385 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK1O75385 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK1O75385 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ULK1O75385 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ULK1O75385 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ULK1O75385 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ULK1O75385 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ULK1O75385 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ULK1O75385 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ULK1O75385 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ULK1O75385 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ULK1O75385 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ULK1O75385 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK1O75385 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK1O75385 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK1O75385 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK1O75385 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK1O75385 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK1O75385 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK1O75385 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK1O75385 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK1O75385 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK1O75385 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK1O75385 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK1O75385 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK1O75385 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK1O75385 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK1O75385 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK1O75385 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK1O75385 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK1O75385 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK1O75385 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK1O75385 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK1O75385 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK1O75385 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms