Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITX3O75364 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX3O75364 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX3O75364 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX3O75364 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX3O75364 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX3O75364 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX3O75364 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX3O75364 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX3O75364 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX3O75364 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX3O75364 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITX3O75364 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITX3O75364 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX3O75364 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX3O75364 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX3O75364 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX3O75364 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX3O75364 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX3O75364 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITX3O75364 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PITX3O75364 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITX3O75364 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITX3O75364 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX3O75364 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms