Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN2O75298 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN2O75298 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN2O75298 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN2O75298 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN2O75298 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN2O75298 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN2O75298 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN2O75298 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN2O75298 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN2O75298 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN2O75298 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN2O75298 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN2O75298 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN2O75298 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN2O75298 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN2O75298 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN2O75298 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN2O75298 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN2O75298 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN2O75298 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN2O75298 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN2O75298 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN2O75298 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN2O75298 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN2O75298 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN2O75298 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN2O75298 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN2O75298 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN2O75298 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN2O75298 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN2O75298 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN2O75298 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN2O75298 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN2O75298 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN2O75298 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN2O75298 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN2O75298 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN2O75298 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN2O75298 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN2O75298 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN2O75298 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN2O75298 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN2O75298 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN2O75298 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN2O75298 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN2O75298 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN2O75298 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN2O75298 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN2O75298 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN2O75298 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN2O75298 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN2O75298 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN2O75298 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN2O75298 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN2O75298 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN2O75298 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN2O75298 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN2O75298 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN2O75298 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN2O75298 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN2O75298 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN2O75298 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTN2O75298 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTN2O75298 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTN2O75298 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN2O75298 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN2O75298 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN2O75298 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN2O75298 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN2O75298 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN2O75298 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN2O75298 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN2O75298 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN2O75298 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN2O75298 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN2O75298 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN2O75298 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN2O75298 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN2O75298 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN2O75298 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN2O75298 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN2O75298 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN2O75298 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN2O75298 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN2O75298 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN2O75298 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN2O75298 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN2O75298 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN2O75298 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN2O75298 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN2O75298 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN2O75298 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN2O75298 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN2O75298 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN2O75298 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN2O75298 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN2O75298 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN2O75298 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN2O75298 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms