Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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PRAMEF10O60809 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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PRAMEF10O60809 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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PRAMEF10O60809 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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PRAMEF10O60809 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
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PRAMEF10O60809 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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PRAMEF10O60809 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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PRAMEF10O60809 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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PRAMEF10O60809 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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PRAMEF10O60809 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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