Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSCO60682 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSCO60682 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSCO60682 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSCO60682 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSCO60682 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSCO60682 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSCO60682 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSCO60682 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSCO60682 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSCO60682 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSCO60682 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSCO60682 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSCO60682 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSCO60682 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MSCO60682 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSCO60682 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSCO60682 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MSCO60682 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSCO60682 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSCO60682 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSCO60682 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MSCO60682 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSCO60682 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSCO60682 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSCO60682 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSCO60682 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSCO60682 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSCO60682 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSCO60682 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSCO60682 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MSCO60682 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSCO60682 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSCO60682 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MSCO60682 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSCO60682 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSCO60682 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSCO60682 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MSCO60682 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSCO60682 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSCO60682 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MSCO60682 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSCO60682 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSCO60682 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSCO60682 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSCO60682 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MSCO60682 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSCO60682 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MSCO60682 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSCO60682 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MSCO60682 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MSCO60682 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSCO60682 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSCO60682 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSCO60682 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSCO60682 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSCO60682 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSCO60682 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSCO60682 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSCO60682 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSCO60682 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSCO60682 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSCO60682 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MSCO60682 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSCO60682 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSCO60682 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSCO60682 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSCO60682 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSCO60682 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSCO60682 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSCO60682 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSCO60682 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSCO60682 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSCO60682 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MSCO60682 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSCO60682 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSCO60682 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSCO60682 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSCO60682 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSCO60682 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSCO60682 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSCO60682 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSCO60682 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSCO60682 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms