Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR5O60602 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR5O60602 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR5O60602 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR5O60602 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR5O60602 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR5O60602 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR5O60602 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR5O60602 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR5O60602 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR5O60602 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR5O60602 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR5O60602 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR5O60602 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR5O60602 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR5O60602 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR5O60602 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR5O60602 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR5O60602 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR5O60602 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR5O60602 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR5O60602 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR5O60602 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR5O60602 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR5O60602 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR5O60602 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR5O60602 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR5O60602 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR5O60602 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR5O60602 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR5O60602 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR5O60602 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR5O60602 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR5O60602 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR5O60602 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR5O60602 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR5O60602 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR5O60602 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR5O60602 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR5O60602 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR5O60602 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR5O60602 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR5O60602 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR5O60602 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR5O60602 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR5O60602 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR5O60602 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR5O60602 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR5O60602 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR5O60602 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR5O60602 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR5O60602 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR5O60602 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR5O60602 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR5O60602 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR5O60602 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR5O60602 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR5O60602 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR5O60602 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR5O60602 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR5O60602 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR5O60602 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR5O60602 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR5O60602 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR5O60602 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR5O60602 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR5O60602 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR5O60602 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR5O60602 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR5O60602 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR5O60602 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR5O60602 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR5O60602 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR5O60602 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR5O60602 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR5O60602 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR5O60602 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR5O60602 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR5O60602 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR5O60602 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR5O60602 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR5O60602 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR5O60602 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR5O60602 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR5O60602 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms