Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD2O60548 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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