Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EXTL3O43909 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms