Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CYTH3O43739 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms