Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDELR3O43731 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms