Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC3O43617 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC3O43617 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms