Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms