Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN3O15551 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN3O15551 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms