Protein–RNA interactions for Protein: O15397

IPO8, Importin-8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO8O15397 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IPO8O15397 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IPO8O15397 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IPO8O15397 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IPO8O15397 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IPO8O15397 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IPO8O15397 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IPO8O15397 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
IPO8O15397 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IPO8O15397 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IPO8O15397 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IPO8O15397 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IPO8O15397 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IPO8O15397 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IPO8O15397 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IPO8O15397 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IPO8O15397 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
IPO8O15397 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IPO8O15397 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IPO8O15397 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IPO8O15397 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IPO8O15397 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IPO8O15397 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IPO8O15397 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
IPO8O15397 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IPO8O15397 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IPO8O15397 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IPO8O15397 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IPO8O15397 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IPO8O15397 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IPO8O15397 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IPO8O15397 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IPO8O15397 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IPO8O15397 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IPO8O15397 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IPO8O15397 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IPO8O15397 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IPO8O15397 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IPO8O15397 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IPO8O15397 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IPO8O15397 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IPO8O15397 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IPO8O15397 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IPO8O15397 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IPO8O15397 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IPO8O15397 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IPO8O15397 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IPO8O15397 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IPO8O15397 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IPO8O15397 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IPO8O15397 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IPO8O15397 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IPO8O15397 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IPO8O15397 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IPO8O15397 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IPO8O15397 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IPO8O15397 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IPO8O15397 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IPO8O15397 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IPO8O15397 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IPO8O15397 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IPO8O15397 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IPO8O15397 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IPO8O15397 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IPO8O15397 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IPO8O15397 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IPO8O15397 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IPO8O15397 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IPO8O15397 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IPO8O15397 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IPO8O15397 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IPO8O15397 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IPO8O15397 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IPO8O15397 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IPO8O15397 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IPO8O15397 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IPO8O15397 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IPO8O15397 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IPO8O15397 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IPO8O15397 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IPO8O15397 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IPO8O15397 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IPO8O15397 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IPO8O15397 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms