Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLK1O15075 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCLK1O15075 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DCLK1O15075 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCLK1O15075 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DCLK1O15075 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCLK1O15075 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLK1O15075 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLK1O15075 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLK1O15075 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLK1O15075 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms