Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYNJ2O15056 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SYNJ2O15056 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms