Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A2O14975 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A2O14975 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms