Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASKO14936 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASKO14936 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASKO14936 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASKO14936 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASKO14936 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASKO14936 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASKO14936 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASKO14936 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASKO14936 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASKO14936 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASKO14936 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASKO14936 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASKO14936 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASKO14936 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASKO14936 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASKO14936 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASKO14936 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASKO14936 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASKO14936 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASKO14936 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASKO14936 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASKO14936 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASKO14936 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASKO14936 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms