Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IKBKBO14920 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IKBKBO14920 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms