Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN9O14815 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN9O14815 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms